Crear un Script para cambiar un Registro

Saludos,

Puedes usar los Tokens que permite For /F, es decir, cortar en trozos la salida de un comando mediante un caracter (en este caso el la Coma y el Espacio) y luego solo tomar los trozos que uno necesite:

Código

@Echo Off
For /F "tokens=3,4,5,6,8,* delims=, " %%a In (
  'Reg Query "HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\SubSystems" /V Windows'
) Do (
  Echo %%a %%b %%c,%%d,2048 %%e %%f
)
Pause

Lo cual devuelve:

Citar

%SystemRoot%\system32\csrss.exe ObjectDirectory=\Windows SharedSection=1024,20480,2048 Windows=On SubSystemType=Windows ServerDll=basesrv,1 ServerDll=winsrv:UserServerDllInitialization,3 ServerDll=sxssrv,4 ProfileControl=Off MaxRequestThrea ds=16

---
Teniendo en cuenta que los Tokens completos serían

+-------------------------------------------------------------+--------------------+ | 1 | 2 | +-------------------------------------------------------------+--------------------+ | HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session | Manager\SubSystems | +-------------------------------------------------------------+--------------------+ | Windows | REG_EXPAND_SZ | +-------------------------------------------------------------+--------------------+ +---------------------------------+--------------------------+--------------------+ | 3 | 4 | 5 | +---------------------------------+--------------------------+--------------------+ | | | | +---------------------------------+--------------------------+--------------------+ | %SystemRoot%\system32\csrss.exe | ObjectDirectory=\Windows | SharedSection=1024 | +---------------------------------+--------------------------+--------------------+ +-------+-----+------------+ | 6 | 7 | 8 | +-------+-----+------------+ | | | | +-------+-----+------------+ | 20480 | 768 | Windows=On | +-------+-----+------------+ +------------------------------------------------------------------------------------------------------- | * +------------------------------------------------------------------------------------------------------- | +------------------------------------------------------------------------------------------------------- | SubSystemType=Windows ServerDll=basesrv,1 ServerDll=winsrv:UserServerDllInitialization,3 ServerDll=sxssrv,4 ProfileControl=Off MaxRequestThreads=16 +-------------------------------------------------------------------------------------------------------

La primera línea se pierde (obvia) porque no tiene el token 3

Para que haga la modificación en el Registro debes cambiar el Echo por un Reg Add así:

Código

@Echo Off
For /F "tokens=3,4,5,6,8,* delims=, " %%a In (
  'Reg Query "HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\SubSystems" /V Windows'
) Do (
  Echo %%a %%b %%c,%%d,2048 %%e %%f
  Reg Add "HKLM\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager\SubSystems" /V Windows /T REG_EXPAND_SZ /D "%%a %%b %%c,%%d,2048 %%e %%f" /F
)
Pause

También recuerda que como se está modificando un valor de HKLM será necesario ejecutar el Script con permisos de Administrador