Se haría así:

Del /Q /S /A /F "%Temp%\*"

O también:

RD /Q /S "%Temp%\" && (MKDir "%Temp%")

Pero lo correcto sería dejar que el limpiador de Windows eliminase el contenido del directorio temporal y decida que archivos se deben eliminar, pues NO es sano eliminar todo de golpe ya que algunos archivos temporales se pueden encontrar abiertos (en uso) por el S.O. u otras aplicaciones del sistema y por ende los archivos que estén relacionados con esos archivos en uso no deberían eliminarse a la ligera.

Como llamar al limpiador de Windows para eliminar solamente el contenido de la carpeta Temporal:

@Echo OFF
 
:: Converted with Reg2Bat by Elektro: http://foro.elhacker.net/net/source_reg2bat_convierte_archivos_de_registro_a_scripts_batch-t394702.0.html
REG ADD "HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\VolumeCaches\Temporary Files" /V "StateFlags0030" /T "REG_DWORD" /D "0x00000002" /F 1>NUL
 
CLEANMGR.exe /sagerun:30
 
Pause&Exit

Saludos

Ya puestos en el tema, existe algun comando para que el archivo bat se ejecute automaticamente como administrador? Que el usuario no tenga que darle al boton derecho y luego elegir la opcion de ejecutar como administrador. Si lo hay, agardeceria que lo compartieras conmigo.

Saludos Elektro