¿Y si no le mandas nada no es lo mismo que dejarlo parado? El servidor estará a la espera de una orden, sino se la mandas, se mantendrá a la espera. Para qué quieres un comando que lo pause si mientras no le mandes nada el troyano no tiene por qué hacer nada.
Si lo que quieres es que se cierre mientras no lo use, ponle un end, pero entonces no sé como vas a volver a ejecutarlo  . A no ser que uses otro archivo auxiliar para volver a lanzarlo no sé...