No comprendo muy bien qué preguntas, ¿quieres guardar en la matriz los datos según se vayan introduciendo?, en ese caso debes usar dos bucles anidados como has puesto en tu código:

for(i=0;i<n;i++)
      {  for(j=0;j<m;j++)
         {
          printf("ingrese numero de lesionados para la interseccion entre [Avenida %d,Calle %d]: ",i,j);
 
          scanf("%d",&cruce [j].(*R).lesionados);
 
printf("ingrese cantidad de vehiculos involucrados en la interseccion[Avenida %d,Calle %d]: ",i,j);
 
          scanf("%d",&cruce [j].(*R).vehiculos);
 
printf("ingrese fecha del accidente en la interseccion [Avenida %d,Calle %d]: ",i,j);
 
          scanf("%d",&cruce [j].(*R).fecha);
         }
         }

Pero esto no es correcto:


En primer lugar "cruce" es una tabla bidimensional, no puedes dejar uno de los parámetros vacíos asi que debes poner también el número de filas (i):

&cruce[i][j].DATO

No entiendo muy bien qué ese "(*R)", pero no es necesario... a la tabla debes acceder con estos códigos:

cruce[i][j].lesionados
cruce[i][j].vehiculos
cruce[i][j].fecha

Lo cual tampoco te va a funcionar si no defines la tabla como tipo "accidente", es decir, asi:

void Llenar(accidente cruce[10][20],int n, int m,int accidentes) //En la función
 
int main()   //En el main
{
 
    accidente cruce[10][20];
.
.
.
}

Otra cosa es que usas variables que no has declarado, como por ejemplo la tabla "a" no está declarada en el main ni la variable "accidentes" (la primera se la pasas a la función "Mostrar" y la segunda a la función "Llenar").

Y por último en los codicionales haces lo siguiente:

If
{
//Instrucciones
}
{
else
//Instrucciones
}

El else no va dentro de las llaves, la estructura es siempre:

Instrucción principal
{
Instrucciones que la componen.
}

Con esto el programa funciona correctamente. Te he anotado los fallos pero los has cometido en varios lados del algoritmo, asi que revísalo entero.

Saludos.