Seguramente el problema es que no copias bien el PE del primer programa, pero es una suposición. Deberías poner tu código, ejemplos, la idea que tienes del problema... etc. Así no puedo ayudarte mucho
Un saludo. Sagrini

Ya... ¿Hacemos ingenieria Inversa?, ¿Adivinamos lo que has hecho? si es asi ¿Cuanto tendremos de retribución?... una cosa es querer ayudarte y otra que nos dejes a ciegas y adivinar lo que has hecho/quieres hacer, por otro me parece que el problema esta mal planteado...

Nota. Aprende primero que es el Formato PE y a que se refiere, por que extraer el PE implica que el EXE esta dentro de un lugar X... y lo deseas extraer (como si estubiera en un zip...), creo que quieres leer cada campo de las estructuras implicadas en el Formato PE (esto se entenderia mejor ya que el archivo que subiste trae 2 archivo en formato PE de dudosa procedencia que nunca ejecute).

Dulces Lunas!¡.

EI: juntando mensajes.

Acabo de ver los archivos con un editor Hexadesimal y lo que pasa es que TODOS lo caracteres que NO SON IMPRIMIBLES los pasa a espacios... una vez mas pon tu codigo... a simple vista lo que hiciste fue abrir un exe con el block de notas y guardarlo en un txt y despues guardarlo en un EXE si es este proceso entonces es un proceso errado por lo que ya te mencione... debes abrir el archivo en modo BINARIO, y si lo visualizas visualizalo en Hexadecial...

Por ejemplo:

*Los Bytes 0x00 pasan a ser 0x20...

Dulces Lunas!¡.

para darle un nombre podria ser "como extraer bytes de un exe"
bueno a mi se me ocurre mapear el archivo y guardarlo en una string unicode
luego abrir un nuevo archivo e insertar los bytes asi de sencillo
para mapear:

CreateFile
CreateFileMapping
MapViewOfFile

oh si!
en un arrays de bytes no
es que lo habia hecho en VB

Trabaja con esto:

#include <fcntl.h>
 
int main ()
{
	int origen=open ("./origen", O_RDONLY), destino=open ("./destino", O_RDWR|O_CREAT|O_TRUNC, 0777); char buffer [15];
	read (origen, buffer, 15); write (destino, &buffer, sizeof (buffer));
	close (origen); close (destino); return 0;
}