Te seré sincero: Lo que haces en el IDE tendrás que hacerlo igualmente como comando.
De todos modos, es importante ver cómo hacerlo a mano, para saber cómo trabaja el IDE. Poner librerías y estos temas muchas veces puede ser un dolor de cabeza en C++.
Sobre cómo empezar... Mejor que busques por internet. Para lo básico, te puedo decir la cadena clave:
g++ codigo.cpp -o ejecutable.exe
Pero hay muchos argumentos más que puedes meterle y muchas cosas que hacer.
La verdad, si buscas por internet sobre casos específicos, tendrás mucha más información. Busca sobre "compilar varios archivos en C++ GCC", por ejemplo. Depende de lo que quieras.