No hay razon para continuar usando esos viejos troyanos bifrost, poison ivy, sub7, etc. completamente incompatibles o lleno de errores al ejecutar en nuervas versiones de Windows. un simple troyano para empezar seria darkcomet:  https://www.sendspace.com/file/gyb0ie
El sitio oficial esta muerto, el autor es ahora de los 'chicos buenos' debido a esta misma herramienta que fue muy usado como troyano bancario.

Publica el código para saber cual es el problema

Carga las aplicaciones para de una vez para saber cual es el problema.

Elektro, hiba a responderte cada parrafo pero es inutil, estariamos discutiendo por algo tan ridiculo, nadie sabe qué tipo de aplicaciones son y qué tipo de problemas tienen entonces simple, el usuario ya tiene dos opciónes: usar Process Monitor para que te muestre un log de los eventos y quien sabe qué podras deducir de eso o cargar las aplicaciones para que podamos hecharle un vistazo para saber cual es el problema sin tanto rodeo.

Si realloc devuelve un nulo, el puntero a memoria es aún valido, la memoria no es liberada

Sí, y usando Process Monitor que se puede esperar a mirar para resolverlo? Sabes que esa herramienta muestra solamente eventos de llamadas a funciones de servico del sistema y el problema que más bien parece de sincronización o algun tipo de espera a un evento o algo por el estilo asi que por ejemplo cómo podrias saber que éste queda en modo de espera al llamar a alguna funcion del sistema como WaitForSingleObject usando una herramienta como Process Monitor? Mejor si quiere perder el tiempo buscando una razón al problema para de ultimo no pueda hacer nada pues que abra la aplicación con algún depurador o usar un API spy y monitorizar la aplicación, incluso de esa manera qué se espera hacer modificar la aplicación? (Que solución...), no se sabe nada de la aplicaciónes, nada del entorno.

Mejor se empieza con cosas más razonables, ya que el usuario está ejecutando las aplicaciónes en Windows 8, donde un resto de aplicaciones comerciales han dejado de funcionar pues que intente ejecutarles en un Windows 7 o XP. Mejor aún, que cargue las aplicaciones para hecharles un vistazo.

No olvidar validar el puntero devuelto por realloc, éste podria ser un valor nulo asi que  se sobreescribiria la variable con el puntero valido a la memoria dinamica como resultado dando una fuga de memoria. Además porqué no simplemente usar memcpy o strcpy para copiar las cadenas de entrada en lugar de usar un for y tener multiples variables. algunos compiladores puede que no optimizen esas partes.

Veo que estás implementado una especie de std::string, puede que estes interesado en hecharlo un vistazo a las librerias del compilador (VC++):
%ProgramFiles%\Microsoft Visual Studio <Version>\VC\crt\src

O unas más "claras" y simples:
http://www.keithschwarz.com/interesting/

->  code/string/String.cpp.html

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Acerca del problema usando el compilador, no es especifico del compilador y más bien deberias de estar feliz que VC++ agrega comprobadores para detectar que se está escribiendo en memoria no reservada y corrompiendo memoria del heap.

Luce como un problema de la aplicación ¿has intentado en otras versiones de Windows? Solo mostrando una imagen y una breve explicación se logra nada. Quien sabe que hacen esas aplicaciónes, etc. Mejor contacta al desarrollador del programa.

Entonces publica algo con lo que la gente que quiere ayudar pueda trabajar, ese es un problema cómun, muchos usuarios vienen a pedir ayuda y publican código incompleto, algunos que responden incluso toman ese código incompleto aunque sea código simple hacen suposiciones innecesarias, crean sus propias versiones, se crea una gran discución y por ultimo muchas veces termina siendo un problema que no tenia que ver con lo descrito, en fin.

Además decir algo como que el error se genera solo en un compilador X es casi como decir que ese compilador tiene un error al generar el código. Tu código es simple y aunque tenga miles de lineas en el main simplemente declaras un clase (?) y llamas a un metodo entonces simple: Publica la declaración de la clase, los constructores, operador y solamente ese metodo que llamas, con eso es suficiente para que alguien pueda trabajar.

Si es para Windows el mejor IDE y compilador es Visual Studio con VC++ (Version recomendada Visual studio 2013) :-)

Ese código, el del primer Post, está incompleto o está mal escrito y no compilará en ningun compilador : )