normalmente los cambios grandes los hago por la mañana (hora España, GMT +1), que hay menos tráfico, pero a la madrugada es peligroso, si está uno muy cansado podría no ver los posibles errores
Queda pendiente la instalación del PHP 5.3, ya que ahora usamos el 5.2 y creo que el APC (Alternative PHP Cache) ya es compatible con la rama 5.3.
Trata de avisar con Antelacion, somos un poco paranoicos... hemos tratado mucho con AVIRA y es contagioso