El Ollydbg te sirve para todo, no necesitas generalmente de otra herramienta mas para crackear. Ahora bien, para que el archivo quede modificado de manera definitiva, haces lo siguiente:
clik derecho sobre la parte del codigo modificado, es decir justo donde cambiaste el JZ por JMP, y clikas en "Copy to executable" de allí clikas en "All modifications" (esto te sirve por si has hecho varias modificaciones).
Luego te sale una ventanita, clikas en el boton "Copy all", te sale una ventana mas grande, de nuevo das clik derecho, clikas en "Backup" y finalmente en "Save data to file", con esto te sale la ventana de guardar, por defecto deberias guardar el archivo exe con el mismo nombre, pero todos los crackers saben que deben renombrar el exe para dejar intacto el original. Muy bien, eso es todo, espero que te haya servido de algo. Saludos