Puedes intentar reparar el sistema con el disco de instalación, pero mi concejo es meter un live cd de linux sacar los datos hacer un low level format para controlar la infección y reinstalar... mi humilde opinión nada mas.
Busca un windows igual que el tuyo y dale reparar, randomize a dejado buenos enlaces, si fueras mas amable de explicar un poco mejor tu problema..... tambien el hiren'ts boot cd es bueno en estos casos