http://es.wikipedia.org/wiki/Formato_de_archivohttp://en.wikipedia.org/wiki/File_formatlos formatos de archivo son la forma en como están estructurados...
no existen diferencias reales entre formatos, todo depende de como fue construido...
por ejemplo el formato GIF, nada tiene que ver con el JPEG el cual si tiene un muy ligero parecido con el MPEG
archivos contenedor son archivos que están armados de modo tal que adentro contienen otros archivos...
la diferencia entre archivos imagenes y musica es tanta como la diferencia entre los formatos de musica entre ellos y los de imagenes entre ellos
ej, el formato mp3
el formato gif
y aquí informacion en detalle más profundo
http://www.fileformat.info/