Código:
while($diferencia > 3600 or $diferencia == 3600){
echo "<br>pasaron mas de 60 min, se actualiza "; //realiza la actualización de la db con los nuevos datos
$conexion=conectar();
$res1=mysqli_query($conexion,'SELECT * FROM jugadores where owner_id='.$_SESSION['id_usuario']);
$row = mysqli_fetch_assoc($res1);
$habilidadphr=$row[habilidad_phr];
$fecha1 = $row[lastupdate]; //lastupdate
$updatetime=(3600 + $fecha1); //fecha vieja + 3600 o sea 60 min
mysqli_query($conexion,'UPDATE ciudades SET lastupdate=("'.$updatetime.'") where owner_id='.$_SESSION['id_usuario']);
mysqli_query($conexion,'UPDATE ciudades SET habilidad=habilidad+("'.$habilidadphr.'") where owner_id='.$_SESSION['id_usuario']);
$diferencia=($diferencia-3600);
} //cierre while
espero puedan ayudarme como ya lo han hecho hasta ahora.
Saludos!