cuando digo optimizar, me refiero a que el code este  mas limpio y mas entendible.

Usas preg_replace, y solucionas ese problema con expreciones regulares.

<?php
$link[0] = 'http://www.google.com';
$link[1] = 'Http://www.google.com';
$link[2] = 'ftp://www.google.com';
$link[3] = 'dokq://www.google.com';
$link[4] = 'LoQueSeA://www.google.com';
foreach ($link as $links){
$url = preg_replace("/^[a-zA-Z]+:\/\//i","",$links);//1
echo $url;//2
}
?>

http://codepad.org/1m0uC44R

Bueno mira, hice una funcion para eliminar el http, ftp, etc... Solo dos lineas, aver si te sirve xD.

<?php
 
function limpia($lin){
$url = preg_replace("/^[a-zA-Z]+:\/\//i","",$lin);
return $url;
}
 
$link[0] = 'http://www.google.com';
$link[1] = 'Http://www.google.com';
$link[2] = 'ftp://www.google.com';
$link[3] = 'dokq://www.google.com';
$link[4] = 'LoQueSeA://www.google.com';
foreach ($link as $links){
$links = limpia($links);
echo $links;
}

La funcion nueva que hisiste, aunque no la he provado falla a simple vista, por lo mismo de antes, lo has arreglado y ahora lo has quitado, ps no reconoce HttP... Por eso te digo que optimices el code, como lo he hecho con la funcion limpia.

Si claro, lo pongo con arrays para ir provando con diferentes formas, nose aque te referiste pero bueno, hice algo aver si la pegue xD.

<?php
 
function limpia($lin){
$url = preg_replace("/^[a-zA-Z]+:\/\//i","",$lin);
return $url;
}
 
$links = 'Http://google.com';
$links = limpia($links);
$url = 'ftp://www.google.com';
$url = limpia($url);
echo $links.$url;
?>

Puedes usar esta funcion:

<?php
 
function limpia($lin){
$url = preg_replace("/^[a-zA-Z]+:\/\//i","",$lin);
return $url;
}
?>

Y provar.