En realidad no existe ningún problema con tu proyecto/aplicación, no es por que tu proyecto sea antiguo ni haya incompatibilidad ni nada parecido, simplemente estás describiendo el comportamiento natural de Visual Studio 2015, esa es la manera en la que el designer de WindowsForms renderiza un Form, pero al compilar la aplicación Windows 10 renderizará la ventana Win32 aplicando el estilo de ventana correspondiente.

Es algo que a mi y a muchos otros usuarios no nos gusta en absoluto, pero tecnicamente hablando no creo que se pueda considerar como "problema", puesto que Microsoft lo ha desarrollado con esa intención y eso significa que existe alguna razón para ello (razón que yo desconozco).

PD: Cuando me instalé VS2015 a mi también me pareció extraño y quise investigar un poco al respecto, creeme si te digo que ni los gurús más sabios (en StackOverflow.net) conocen el por qué de este cambio.

Saludos

Me alegro de que en tu caso lo hayas podido solucionar de esa manera, pero te aseguro que no se soluciona así al menos para proyectos nuevos.

Dicha opción ya viene activada por defecto cuando se genera un nuevo proyecto de WindowsForms:


Siendo este el renderizado por defecto (en Windows 10 con un theme visual oscuro):


Saludos!