No es posible

El .net framework es un conjunto de lenguajes, runtimes y compiladores ( y creo que algunas cositas mas)

Tienes que tomar en cuenta que las dependencias del Framework tienen depencias y a su vez estas tienen más dependencias. Si tú aplicación depende por ejemplo de System.Dll está puede depender de otra dll y esa de otra, hasta puede ser más de una. Si es posible correr "Sin NetFramwork" y lo pongo entré comillas porqué si copias todas las dependencias necesarias a donde está la aplicaión obvio que funcionara pero eso incluye Megas y Megas de archivos, no es aconsejable hacerlo.

Tengo que buscar, por aquí tengo un código que al pasarle un Assembly, obtiene todas las dependencias necesarias para iniciar la aplicación sin el NetFrameWork, y el peso aproximado del ejecutable, pero lo deje a medias, se supone que usaba un algoritmo para comprimir las dependencias dentro del assembly. Muy parecido a la respuesta de arriba.

Como que 3MB? Si un "Hola Mundo" en sharp debe de pesar unos 5KB

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[Edito]
Ahora veo que te referías a empaquetar el .NET con la aplicación que han mencionado antes.

Saludos
 

Un trozo de código que muestra como:

  Dim [Assembly] As Assembly = Assembly.LoadFile("C:\Ejemplo.exe")
 
        For Each Dll As AssemblyName In [Assembly].GetReferencedAssemblies
            Console.WriteLine(Dll.Name & " " & Dll.Version.ToString)
        Next

Solo me muestra MsCorEE (O era MsCord¿?) aún incluyendo la dll en el directorio junto con lo demás no funciona. D:

@seba123neo
Como podría embeber las referencias en la aplicación, lo he intentado pero no me funciona.
Por cierto, esto:
Portable Library Tools - VisualStudio MSDN
Alguien con "VS 2010 sp1" podría probarlo xD, ¿precisamente para que sirve? (No tengo el sp1, y son 512mb de descarga D:)

SaluDOS!