Si te refieres a comprobar un email, pues para eso ya tienes Verify Email o Email ID Checker los cuales me han sido muy útiles para limpiar mi lista de contactos. Eso si, antes de usarlos te recomiendo que primero pruebes con algunos emails que sepas que son validos o inactivos ya que a veces me han aparecido falsos positivos (no es algo común, pero en ocasiones uno de los sitios tiene algún problema con los servidores de Hotmail y en ese caso las comprobaciones pueden fallar).

Efectivamente, lo mas logico es enviar el correo electronico; esa es la unica forma de saber con precision si esa cuenta/correo sigue activa. El riesgo es que si durante ese proceso recibes muchos mensajes devueltos como desactivados o no existentes, corres el riesgo de ser bloqueado por los proveedores de servicio de internet (ISP).
Yo aprendi que lo mejor en estos casos es dejarle el trabajo a los expertos. Despues de mucho buscar y probar encontre una compania norteamericana que hace ese trabajo a la perfeccion. Solo tienes que abrir una cuenta con ellos y subir tu archivo, ellos se encargan del resto. Te mantienen informado durante el proceso y sus tarifas son asequibles. Yo los recomiendo totalmente. Los encuentras en http://www.GreenAppleMail.com