Casi casi lo tiene dog  , recorrer con doble ciclo for como haces con el método suma, porque debes recorrer cada indice, me da aburrimiento máximo llenarla, pero aleatoria nom y así ahorras tiempo en desarrollo, no apto para produccion  

public class Bidimensional {
 
	private double[][] matriz;
	private int	renglones;
	private int columnas;
 	private static final SecureRandom SR = new SecureRandom();
	private static final DecimalFormat TWO_DIGITS = new DecimalFormat("#.##");
 
	public Bidimensional(int renglones, int columnas) { // constructor y pido el ingreso de valores a matrices
		Scanner entrada = new Scanner(System.in);
		this.matriz = new double [renglones][columnas];
 
		for(int i=0 ; i<renglones; i++)
		{
			for(int j=0; j<columnas; j++) {
				matriz[i][j]= Double.valueOf(TWO_DIGITS.format(1 + SR.nextDouble()));
				System.out.print("Ingresar el numero de matriz ["+i+":"+j+"]: ");
				System.out.println(matriz[i][j]);
 
			}
		}
	}
 
	public double[][] suma(Bidimensional m2) // operacion de suma
	{
		for(int i=0; i<2; i++) {
			for(int j=0; j<2; j++)
			{
				matriz[i][j]= matriz[i][j] + m2.matriz[i][j];
			}
		}
 
		return matriz;
	}
 
        public double format(final double num) {
            return Double.valueOf(TWO_DIGITS.format(num).replace(",", "."));
        }
 
 	public static void main(String ...blalba) {
 
		final Bidimensional matris = new Bidimensional(2,2);
		final Bidimensional matris2 = new Bidimensional(2,2);
 
		final double[][] resultado = matris.suma(matris2);
		//Recorrer el Array de doble dimension, con java 8, java 7 usa doble for
		Arrays.stream(resultado)
				.flatMapToDouble(Arrays::stream)
                                .map(this::format)
				.forEach(System.out::println);
 
	}
}

Ingresar el numero de matriz [0:0]: 1.32
Ingresar el numero de matriz [0:1]: 1.8
Ingresar el numero de matriz [1:0]: 1.62
Ingresar el numero de matriz [1:1]: 1.71
Ingresar el numero de matriz [0:0]: 1.53
Ingresar el numero de matriz [0:1]: 1.6
Ingresar el numero de matriz [1:0]: 1.6
Ingresar el numero de matriz [1:1]: 1.57
2.85
3.4
3.22
3.28
 
Process finished with exit code 0

public double[][] suma(Bidimensional m2) // operacion de suma 
{
for(int i=0; i<matriz.length; i++) {
	for(int j=0; j<m2.matriz[i].length; j++)
	{
		matriz[i][j]= matriz[i][j] + m2.matriz[i][j];
	}
} 
    return matriz;
}

for(int i=0; i<matriz.length; i++) {
  for(int j=0; j<matriz[i].length; j++) {
	matriz[i][j]= matriz[i][j] + m2.matriz[i][j];
  }
}