Por si te sirve:

Yo estuve buscando por internet y encontré esto:

pack();
java.awt.Dimension screenSize = java.awt.Toolkit.getDefaultToolkit().getScreenSize();
setSize(new java.awt.Dimension(X, Y));
setLocation((screenSize.width - X) / 2, (screenSize.height - Y) / 2);
 

y a mi, haciendo un JDialog me ha funcionado perfectamente. He colocado X e Y por dejarlo de una forma un poco más general y que se vea mejor a simple vista que es lo que hace.

Espero que te sea de ayuda.

Saludos.