Mi touchpad como he dicho no funciona el clic izquierdo con windows, pero el caso es que al principio si que funcionaba por eso creo que se debe ha alguna actualización o algo por el estilo. Actualmente tengo windows 10 pero con windows 8 tampoco funciona, el puntero se mueve perfectamente y el botón derecho también, lo único que no funciona es el botón izquierdo y su función, o sea si hago clic en el centro del touchpad tampoco funciona. He realizado varias comprobaciones como desinstalar la aplicación Elan, volverla a instalar, volver a instalar el drivers, actualizarlo, etc y nada. Solo si utilizo un cd de Ubuntu es cuando si funciona a la perfección por eso descarto que sea de harware.
Para mas información:
mi portátil es un msi cx61.
Drivers del touchpad: Elan Input Device
SO: Windows 10 Pro
(FUNCIONA PERFECTAMENTE CON UN MOUSE EXTERNO)
Gracias por vuestra ayuda.

todas las configuraciones estan revisadas y activadas, gracias