No estoy seguro de si es lo que nesecitas, pero haciendole un scanner a la web con acunetix creo que podes ver todos los directorios de una web. Probalo a ver si te funciona
La unica forma de lograrlo seria encontrarle una vulnerabilidad a un web alojada en el servidor y de esa forma llegar a conocer en mas detalle los cirectorios que tiene el hosting.
el Acunetix lo he utilizado, me encuentra las vulnerabilidades, y lo estoy utilizando para otra cuestión pero me a servido bastante bien, pero lo que intentaba conseguir no lo he conseguido, luego preguntarte como puedo utilizar la aplicación java? un saludo y muchas gracias