hola Darion13, podrías implementarlo a titulo educativo, sin embargo si realmente quieres procesar en paralelo es más rentable y eficiente hacerlo vía GPU, sea por CUDA con nvidia o bien con STREAM con amd. la cantidad de nucleos que tiene una placa de video frente a los procesadores, versus gasto energético de las rerspectivas fuentes hace una gran diferencia.


sobre nvidia tienes mas libertades para programar, bajo amd tienes open cl, pero obtienes portabilidad...

aqui te dejo unos enlaces para que orientes la busqueda:

-> http://es.wikipedia.org/wiki/Cluster_Beowulf (s.o.'s  para cluster's de cpu´s)

mediante gpgpu:

-> http://www.nvidia.es/object/cuda-parallel-computing-es.html
         -   http://www.nvidia.com/content/cudazone/download/OpenCL/NVIDIA_OpenCL_ProgrammingGuide.pdf

-> http://developer.amd.com/tools-and-sdks/opencl-zone/
         -   http://amd-dev.wpengine.netdna-cdn.com/wordpress/media/2013/01/Introduction_to_OpenCL_Programming-Training_Guide-201005.pdf

saludos

podrias correr por ejemplo quantian en una virtualizacion, por ejemplo... o en otra particion; con el podrias hacer tu cluster con las cpu's mediante switches.

en las distros linux tienes opciones libres que reemplazan satisfactoriamente a mathlab, el y su similar libre Octave soporta aceleracion gpu:

-> http://www.gnu.org/software/octave/
       - http://www.domob.eu/research/OctaveGPU.pdf
       - http://docs.ihpc.a-star.edu.sg/papers/MMGPUOctave.pdf

ya en windows solo conozco la opcion mediante gpu y cuda... no sabria decirte si podrias utilizar un server m$ y enlazar mediante ssh a las terminales bobas para procesar... si encuentro algo parecido te aviso. saludos