Yo también suelo usar Adobe Acrobat Professional, su
reconocimiento de texto (OCR) funciona muy bien.
Correcto, yo he probado y utilizado bastante Acrobat Pro, las versiones X y XI actualizados tienen un muy buen OCR salvo un par de limitaciones: Problemas al realizar OCR en una página que contiene imágenes y a la vez texto normal, y otro problema al hacer OCR del tipo texto editable para luego editar el texto reconocido, el problema es que en las versiones X y XI no se crea un juego de caracteres para ser utilizados en reemplazo, siempre se tiene que usar una fuente existente en el sistema.
Las versiones nuevas de Acrobat como la 2017 en adelante son más pesaditas pero su OCR es excelente, sin las limitaciones anteriores. Claro que si se va hacer un OCR para búsquedas queda perfecto el XI que es más ligero en consumo de recursos.