El $(document).ready(function(){ /**/ });, es una "función" de jQuery para que se ejecuten las cosas después de cargarse la página. El $('#images'). es para que afecte el selector #images, el .kwicks es un pluggin kwicks. Los { max:600, spacing:2 }, son los parametros del pluggin.
El $('ul.sf-menu').sooperfish();, afecta al selector ul.sf-menu, con otro pluggin. :p
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Te vendería mi talento por poder dormir tranquilo.