A que en C si te lo detecta...
Prueba compilandolo. Aunque eso tal vez lo haga mas detectable... es cuestion de firmas (y herustica).
https://www.tutorialspoint.com/What-are-pyc-files-in-PythonPD: puedes encontrar formas en Internet de construir EXEs a partir de scripts de Python. Lo que mejor se me ocurre a priori es hacerlo y en seguida cifrarlos. Puedes encontrar crypters en todas partes, aunque estarias saliendo de Guatemala y entrando a Guatepeor. Te recomiendo leer la documentacion de Windows para tratar con modulos ejecutables y hacerlo tu mismo.
Saludos.
(Ademas, el ambito de infeccion de un backdoor -pues es mas un backdoor que un troyano- escrito en Python se reduce a ciertos servidores y la mayoria de usuarios con Linux, y aparentemente tu objetivo es el usuario tipico. Esto a menos que incluyas una utilidad para instalar Python de antemano, lo cual, sinceramente, a mi me parece ineficiente).
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