Ya encontré la solución al problema la publico por si le puede servir de ayuda a alguien, ya había intentado por medio de las "Opciones de carpeta" y seleccionar "Mostrar archivos, carpetas y unidades ocultos" pero no me había funcionado, también intente con el programa "Recuva" y tampoco funciono, así que probé con CMD.exe situándome en el directorio de la USB y escribiendo el comando attrib /d /s -h -r -s *.* que me permitió ver los archivos ocultos de la USB.
Después me encontré con una carpeta nombrada FOUND.000 y la carpeta System Volume Information que por lo que tengo entendido alberga principalmente los puntos de restauración y configuraciones del dispositivo, en fin la importante era la FOUND.000, hice un Backup de los archivos que tenia en buen estado y continué.
Luego abrí la carpeta y vi una gran cantidad de archivos con extensión .CHK la cual no conocía.
Buscando por la red encontré que utilizando un programa llamado GetDataBack for FAT podía recuperar los archivos en base a los de extensión .CHK
Por último me quedo una carpeta con los archivos recuperados borre los que no necesitaba, y ya solo falta organizar de nuevo los archivos que por cierto están en buenas condiciones.
Espero que esta información le pueda servir de ayudar a alguien. Y GRACIAS a los que me respondieron.
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