¿A que te refieres con "colores"?
Si lo que quieres es personalizar el icono de un tipo de extensión, es facil, te muestro como hacerlo por consola:
(Para archivos XLS)
Reg ADD "HKCR\.xls\defaulticon" /V "" /D "C:\Ruta del icono personalizado.ico,0" /F
Reg ADD "HKLM\Software\Classes\.xls\defaulticon" /V "" /D "C:\Ruta del icono personalizado.ico,0" /F
PD: Es un ejemplo, no lo he testeado con archivos XLS ya que no uso Excel.
Saludos