En el foro no se puede dar soporte a Windows modificados precisamente por que dada su naturaleza (eliminación de componentes y drivers, alteración de archivos del sistema y otras modificaciones de cualquier tipo) pueden llegar a generar todo tipo de problemas extraños e imprevistos. En muchos casos será dificil o imposible averiguar el motivo, pero la sanación al problema probablemente sea instalar una ISO de Windows original, o al menos eso es lo más sensato que puedes intentar para tratar de solucionar un problema con un Windows modificado.
De todas formas, se me ocurre que puede haber sucedido alguna de estas cosas:
1. Es un problema exclusivo de ese Windows modificado.
2. La partición ha sido completamente destruida por "X" motivo desconocido durante el procedimiento de instalación/actualización de Windows.
3. La tabla de la partición se ha corrompido, o el disco contiene sectores inválidos.
4. Es un bug de Windows que en teoría podrías solucionar buscando el parche adecuado de Microsoft. Por ejemplo aquí puedes encontrar un usuario que tiene el mismo problema que tu, solo que en su caso es al actualizar a Windows 10, y según esta respuesta se pudo solucionar el problema mediante un parche acumulativo de Microsoft (pero es para Windows 10, insisto):
En ese mismo thread de superuser.com puedes encontrar otras respuestas de utilidad, como esta:
https://superuser.com/a/1172873 en la que proporcionan una posible solución universal para todos los Windows que consiste en el uso de programas de recuperación de particiones como por ejemplo
MiniTool Partition Recovery Free, el cual en teoría es capaz de convertir de formato "RAW" a NTFS.
Intenta seguir los pasos de esa respuesta publicada en superuser.com a ver si consigues solucionar el problema con ese programa, concretamente sigue estos pasos:
( ojo, desconozco si este método de recuperación implica la pérdida completa o parcial de datos del disco así que no me hago responsable de nada.
lee todo el tutorial para saber las consecuencias que puede tener antes de intentar llevarlo a cabo. )
Y aquí puedes encontrar otras posibles soluciones:
...pero ya digo, lo primero que deberías hacer al menos para intentar salir de dudas de si es un problema de ese Windows modificado o no lo es, y así de paso intentar no dañar nada de forma innecesaria, es realizar una
instalación limpia (que no actualización) de Windows 7 original.
Saludos!