Hola!

A Resource Hacker lo he usado anteriormente y no creo que sea un problema para la seguridad, siempre y cuando lo bajes desde la web del creador: http://www.angusj.com/resourcehacker/#download

Para editar recursos está el antiguo ResEdit, pero la pagina oficial del mismo ya no existe (la URL original redirecciona a sitios de malware y spam).

PE Explorer también tiene un editor de recursos, es básico e intuitivo: (http://www.pe-explorer.com/peexplorer-tour-resource-editor.htm)

Saludos!