¿Estas buscando aplicaciones portables y si es asi para que SO? Creo que algunas de esas necesitan ser instaladas. Puedes optar por Kali que viene con varias de las apps que mencionas, aunque es una gran diferencia entre tener los binarios sueltos a andar con una distro en una usb.

Sí, aunque sería preferible que tuvieras el SO en directo para bootear desde la maquina yo diria. De todas formas, varias de las apps que mencionas si puedes conseguir su version portable (para win) por ejemplo:

JohnTheRipper

http://www.openwall.com/john/


Nmap

http://nmap.org/book/inst-windows.html

Presta atencion a la parte de Command Line Binaries.

http://nmap.org/dist/nmap-6.47-win32.zip

Netcat:

https://eternallybored.org/misc/netcat/

Aircrack:

http://www.aircrack-ng.org/doku.php?id=downloads

Etc...