Hola
Yo creo que si es más seguro.
si te comunicas de ip a ip
La función atomicio de netcat envia mensajes, como un "chat" y la conexión es directa, puedes probarlo a nivel local y exterior por supuesto.
Si quieres más seguridad tienes ssh, o si eres más paranoico crea un tunel con ipsec con cifrado AES de 256 bits con tú máquina y la otra.
Un saludo.