Te recomiendo que nos pegues un log del hijackthis, podría ser que el malware estuviera compuesto de varios archivos y que uno de ellos cree otro que pueda ser detectado.
Bueno, sin más especulaciónes te paso el enlace para que utilizes el hijackthis, una vez nos pegues el log miraremos lo que puede fallar.
¿Cómo leer un Log de Hijackhis?Con este programa podrémos ver que actividades y archivos malos o sospechosos hay en tu ordenador en forma de texto y te podrémos dar una ayúda personalizada para tu caso.