Bueno, les pido consejo a ustedes que de seguro, sabrán más que yo:
Les pongo en contexto: Tengo un ordenador de 64bits con Windows 7 Ultimate SP1 (64 bits) instalado en  una partición y con Ubuntu 12.04 64 bits en otra. Cuando reinicio mi ordenador para entrar en mi Linux, me doy cuenta de que en mi USB hay un archivo ejecutable llamado i00dvoym.exe y un autorun.inf para autoejecutarlo. Lo elimino desde Linux, vuelvo a Windows, y luego, al volver a Linux, observo que se ha vuelto a copiar, así que está claro que mi Windows ha sido infectado.
En un intento de eliminarlo he seguido esta guia: http://blog.teesupport.com/how-to-guide-remove-i00dvoym-exe-i00dvoym-removal-instructions/ pero no encuentro el proceso en ninguna parte. Además me preocupa que mi queridísimo Linux pudiese haber sido infectado a través de Windows.
Ignorando la perdida de mis contraseñas y otros que podría haber causado el virus... ¿como puedo eliminarlo y cerciorarme de que mi Linux sigue estando impecable?

PD: al pulsar sobre el archivo en linux, me da la opción de abrirlo con Mono runtime, ¿podría esto afectar al hecho de si mi sistema Linux esta infectado o no?

Gracias.

Entiendo..., y gracias por tu respuesta. Y respecto a lo de que los ejecutables no son compatibles... oí una vez, que un virus podía infectar windows y acceder a la partición ext* de linux y instalarlo  tipo los programas estos que hay para usar ext* en windows
Gracias!

el-brujo el windows ya está comprometido, el dijo ya que


siempre que tienes esa clase de virus se vuelve a copiar de inmediato y por lo general se inyectan u ocultan en procesos como el svchost