Se llama batch https://www.tutorialspoint.com/batch_script/batch_script_arrays.htm

Saludos,

- Dependerá del formato de tu entrada, por ejemplo:


etc.

- Tratando de entender tu código previo deduzco que quieres el tipo 001 [enter] 002 [enter] ..., aunque no sé que parte no funciona o que salida deseas obtener. A mí me funciona lo siguiente:

@Echo Off
 
For /L %%i In (0, 1, 5) Do (
  Set /P A[%%i]=
)
 
For /L %%i In (0, 1, 5) Do (
  Set A[%%i]
)
 
Pause

- Si quieres entradas tipo C como 001 [espacio] 002 [espacio] ... tienes que guardar esa String en la variable y luego hacerle un Split con For y quizá tokens y/o delims XD