¿A través del conector? No veo como, el conector no hace nada mas que encajar con los pines.

El RJ45 no es una configuracion, es un conector. Tu estás hablando de las configuraciones del cable de par trenzado y yo tampoco he escuchado de una configuración que provoque que se caiga la red. Pero quizás es posible, hasta hace poco solo sabía de 2 usos y recientemente aprendí otros 3.

https://www.youtube.com/watch?v=7iSC9yXxVVc

Lo único que se me ocurre es conectar un crossover cable en dos puertos de un switch, esto ocasionaria un broadcast storm que basicamente funciona como un DoS.