Solo un trío de pistas (deberían bastarte):

Si el esquema tiene dos dimensiones, ¿por qué esperas hacerlo con un solo bucle?.
No es que no sea posible, es que resulta mucho más complicado para alguien que empieza...

Usa dos bucles anidados. El primero (el externo), sirve para saltar a la siguiente línea. El segundo (el bucle interno), para procesar todos los caracteres de la línea actual (lógicamente la línea actual es la que apunta el bucle externo).

Por último, ...con los valores, dado que hay espacios entre medias, será mejor si antes de nada, guarda los valores en un array de dos dimensiones (y si insistes en usar un solo bucle y un array de solo una dimensión, tendrás que tener en cuenta el ancho de cada línea).

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Tienes todas las pistas necesarias, primero lee esto varias veces, luego piensa y repiensa hasta que puedas planteártelo con claridad en tu mente, luego ya es solo ponerse a escribir código....