Se soluciona haciendo clic en el menu en "View" y desactivando "show Non-printable Characters".

Hace mucho que se escribió este tema, pero me acaba de ocurrir a mí y aunque no esta la solución por ningún sitio lo he solucionado después de un rato nada agradable de investigación, para la ***** que es, así que, aquí lo dejo para posibles futuros afectados.