Es un marcador.

En la cadena de formato de printf y similares cada '%' indica el inicio de un especificador (secuencia de caracteres indicando el tipo a procesar y algunos detalles mas). Si la intención es simplemente imprimir el carácter '%' se debe escapar utilizando '%%'.

Con las funciones scanf y familia el comportamiento es similar (obviamente con la diferencia de ser funciones de entrada), si se desea leer el carácter '%%' se debe escapar de la forma indicada.

Un saludo

jejeje es simplemente la forma en que esta hecha el lenguaje sus creadores lo quisieron asi es bueno que tengas en cuenta tmb cuando es operador modulo como te lo explico omar

Las funciones de entrada y salida con formato (printf, scanf, etc.) son funciones con un numero variable de argumentos (variadic functions) y el numero de estos esta dado por el numero de especificadores como "%d", "%s", etc.

En el caso de las funciones de entrada scanf, fscanf y sscanf todos sus argumentos son punteros pero no estoy seguro si te refieres a eso.

¿Puedes por favor aclarar tu pregunta?

Un saludo