La función debe realizar el siguiente procedimiento:

Identificar y retornar el número de vocales que posee el nombre ingresado.
Reemplazar e imprimir las vocales por el símbolo # en la posición donde fueron localizadas.

este es mi avance y no logro reemplazar las vocales por el símbolo:

int busca_vocales(char *cadena);
 
int main(int argc, char const *argv[])
{
 
	char t[30];
	int i;
	//vocales//
	printf("Escribe un nombre:\n");
	gets(t);
	int vocales = busca_vocales(t);
	printf("El numero de vocales que tiene el nombre es: %d\n", vocales);
 
	//cambiar vocales por ##//
   printf("cambio de vocales por #: %s", t);
      for(i=0;t[i]!='\0';i++){
        if(t[i]=='a')
            t[i]='#';
	else if(t[i]=='e')
            t[i]='#';
	else if(t[i]=='i')
            t[i]='#';
	else if(t[i]=='o')
            t[i]='#';
	else if(t[i]=='u')
            t[i]='#';
    }
 
 
 
	return 0;
}
int busca_vocales(char *cadena){
	int vocales = 0;
	int indice;
 
	for(indice = 0; cadena[indice] != '\0'; ++indice){
			char letraactual = tolower(cadena[indice]);
 
 
		if (
			letraactual == 'a' || 
			letraactual == 'e' || 
			letraactual == 'i' || 
			letraactual == 'o' || 
			letraactual == 'u'
			)
		{
			vocales++;
		}
	}
	return vocales;
} 

---

MOD: El código debe ir entre etiquetas de Código GeSHi

El problema que menciona @Lieutenant McFarley sucede por no utilizar etiquetas de Código GeSHi para agregar códigos.
La letra 'i' entre corchetes '[]' se interpreta como letra cursiva por lo que no se ve en el código y a partir de ahí el resto del código se empieza a ver en cursiva: tal que así

Los códigos se deben insertar usando el desplegable de "Código GeSHi" y seleccionando el lenguaje correspondiente o escribiendo manualmente las etiquetas:
[code=c]
// Codigo C aqui
[/code]

---

Y la respuesta al problema original es: no existe ningún problema.
Se podría mejorar un poco el código ya que ahora mismo sólo se sustituyen las vocales minúsculas y los ifs se pueden juntar en uno solo usando el operador OR (||)
Por lo demás, si muestras la cadena t después del for que reemplaza las vocales, verás que se han reemplazado correctamente...