Compilar a P-Code, seleccionándola haremos que el compilador de VB cree un ejecutable en el que se utiliza "pseudo código". Esta compilación lo que hace es crear un ejecutable más pequeño, ya que prácticamente todo lo que contiene son llamadas a las funciones y código ejecutable del "runtime" de Visual Basic. En la mayoría de los casos, esta será la opción más conveniente, sobre todo si lo que nos interesa es que nuestro ejecutable no ocupe mucho.

El grupo de Compilar a código nativo nos da varias opciones que veremos ahora, la diferencia entre la compilación a código nativo y el P-Code es que en la compilación a código nativo se utiliza un compilador "de verdad", es decir, en lugar de usar funciones que llaman a las que están en el runtime, se sustituyen por código máquina, si bien el runtime de VB sigue utilizándose, ya que no todo el código usado se incluye en el ejecutable. Al compilar en modo nativo, el fichero ejecutable suele ser mucho más grande que el de P-Code, también suele tardar más en compilar, dependiendo de la cantidad de código que tengamos en el proyecto.
Y a pesar de lo que puedas pensar no siempre el resultado de compilar a código nativo suele resultar en un ejecutable más rápido, independientemente de como hayas seleccionados las opciones extras de compilar a código nativo.