Al final ha sido lo que decía PalitroqueZ, por alguna razón UNetbootin no había grabado bien la imagen iso de Ubuntu en el USB. Normalmente funciona, pero esta vez no se que pasó.
por eso preguntaba, yo he probado las diferentes aplicaciones que se consiguen en la red, y no todos crean un boot correcto para los OS,
cuando quiero instalar Windows uso
Rufus y cuando quiero instalar linux uso
Universal USB Installer que ya tiene la lista de distribuciones con su configuración predeterminada.