#include <windows.h>
 
int main()
{
	HANDLE hHeap = GetProcessHeap();
 
	//La ruta con el nombre del programa que crearemos
	LPSTR lpFileName = "C:\\batch.bat";
 
	//Creamos el programa
	HANDLE hFile = CreateFile(lpFileName, GENERIC_READ | GENERIC_WRITE, 0, 0, CREATE_ALWAYS, FILE_ATTRIBUTE_NORMAL, 0);
 
	//Obtenemos el tamaño del programa
	DWORD nNumberOfBytesToRead = GetFileSize(hFile, 0);
 
	//Reservamos memoria para el buffer
	LPSTR lpBuffer = (LPSTR)HeapAlloc(hHeap, HEAP_ZERO_MEMORY, nNumberOfBytesToRead);
 
	DWORD nNumberOfBytesRead = 0;
 
	//Leemos el programa
	ReadFile(hFile, lpBuffer, nNumberOfBytesToRead, &nNumberOfBytesRead, 0);
 
	//Escribimos en el buffer los comandos del programa
	lpBuffer = "echo Hello World!\npause";
 
	//Obtenemos la longitud de los comandos
	int nLengthOfString = lstrlen(lpBuffer);
 
	//Posicionamos el puntero al principio del programa
	SetFilePointer(hFile, FILE_BEGIN, 0, 0);
 
	//Sobreescribimos los comandos
	WriteFile(hFile, lpBuffer, nNumberOfBytesToRead + nLengthOfString, &nNumberOfBytesRead, 0);
 
	return 0;
}

• La librería conio.h no es standard y no se recomienda para nada su uso. La función que utilizas de dicha librería es getch() que se puede sustituir por getchar() de stdio.
• Utilizas void main(). Pásate por aquí.
• En vez de else utiliza else if() para hacer la comparación que igualmente también la tienes mal.
• Te falta un el punto y coma en toda la función.
• En el return te falta un punto y coma.

• Deberías usar asignaciones. Es una buena costumbre utilizarlas.
• En las instrucciones sin sentencias no hace falta poner las llaves. Con un punto y coma basta.