Tengo una pregunta que me intriga que diferencia hay entre importar un api desde coredll que importarla desde kernel32 o user32 y poque coredll tiene funciones que tambien estan en kernel32 y en user32...

Es como dice seba. Importar desde core.dll es solo para la versión compact.

Mira aca
http://www.elguille.info/NET/netCF/ejecutar.htm