Depende de lo que quieras hacer, pero si vas aprender puedes empezar por C# y ASP, .NET solo es una librería y dependiendo de lo que quieras hacer puedes ocuparla o no. Te recomiendo mejor que aprendas a programar y después si lo deseas vez como usar .NET

Bueno, se refiere a que es distinto querer hacer una web dinámica que un programa que maneje gráficos o un driver para windows. Todo depende de a dónde lo quieras enfocar, siempre puedes empezar por un tema e ir cambiando a otros según te sea interesante o útil.

Es importante que consideres a que área quieres enfocarte pues decir que harías lo que sea que las empresas te pidan tienes que saber que estás hablando de un espectro muy grande, es decir puede que una empresa te pida un sistema web, un driver, un sistema experto, un sistema de reconocimiento de voz, un sistema automatizado para el escaneo de libros o bien un sistema que permita reconocer las placas de un auto para que pueda salir de un estacionamiento, también se te podría pedir un sistema inteligente que analice las últimas noticias para predecir el valor de una acción en la bolsa.

Ahora que si hablamos de que sería lo más factible que te pidieran es un sistema de altas, bajas, cambios y consultas en web, para hacer esto te recomiendo que investigues lo siguiente:

- Modelo MVC
- Operaciones CRUD
- Programación ASP en Web
- Servidores IIS

El primer programa que te recomiendo que hagas es un sistema de noticias en web que haga los siguiente

- Los usuarios se registran en el sistema
- Los usuarios se loguean al sistema (através de un nombre de usuario y una contraseña)
- Los usuarios dan de alta nuevas noticias
- Los usuarios pueden dar de baja sus noticias
- Los usuarios pueden borrar sus noticias
- Un usuario administrador que tenga todos los permisos anteriores y que pueda dar de baja usuarios
- Consulta de noticias

Un sistema como el anterior te podría explicar lo básico para programar, un sistema como el que te propongo puedes implementarlo en ASP, PHP, Python, PERL o casi en todo y no es necesario aprender .NET para hacerlo.

Si lo que quieres aprender es Ingenieria en Sistemas Computacionales, te recomiendo que investigues los siguientes conceptos:

- Programación Orientada a Objetos
- Estructuras discretas
- Diseño y análisis de Algoritmos
- Lenguajes Formales y Automátas
- Programación de sistemas
- Compiladores
- Sistemas Operativos
- Ingenieria de software
- Bases de datos
- Redes computacionales
- Seguridad informática
- Sistemas de información
- Inteligencia Artificial