A ver... preguntas como estas creo que son muy repetitivas... Así que no me pondré a hablarte con mis propias palabras, Encima que no has especificado el lenguaje, sino hablas generalizando la plataforma.

Si quieres aprender .NET y no sabes NADA acerca de él, te recomiendo que leas el curso de iniciación a C# de Erik (Sí, sí... te recomiendo C# porque no especificaste nada), luego... podrías leerte éste otro manual, que aunque es un poco corto, conocerás los PRO de C#, los errores más difíciles de detectar al momento de codear y cómo evitarlos. Los contras, ya los irás descubriendo poco a poco (Que no son muchos eh).

Espero haya sido de ayuda, un saludo.

PD: ¡Buena elección!, espero no llegues a mitad de manual, y presiones Alt+F4 .

Edito: Creo que debiste ver éste tema antes de hacer tal pregunta, y yo igual .

Ven hijo mio, join the dark side xD

En broma!

Pues bien que quieras aprender .Net, y sí. Claro C# es la mejor opción si tomamos en cuenta que programas en Java (por lo que veo en tu avatar).

C#, específicamente la versión 4.0 tiene MUCHAS cosas interesantes que será muy dificil encontrarlas en un solo lenguaje de otra plataforma. En wikipedia puedes ver todas las características de .Net.

Sí te interesa linux, échale un ojo a MONO que va muy, muy bien.

Un saludo!