me sucedio algo parecido, puedes utilizar el Subtitle Workshop q es un programa util para manejar subtitulos, entonces lo q hice fue modificar el margen q separa a los subtitulos de la parte baja del video ¿como?, 1ero asegurate de tener o convertir tus subtitulos a formato .ssa, los puedes convertir con el mismo programa guardandolos como "sub station alpha", luego q los tengas ve al menu (del Subtitle Workshop) settings>outputsettings>substationalpha(.ssa)>others y en vertical margin deberias aumentar el valor, para ver como queda reproduce la pelicula con el mismo programa. al final guardas el archivo y estara listo para usar.

si no sabes trabajar con subtitulos .ssa en el virtualdub ps dimelo en un post y te ayudo.

Saludos a jose2c,  que muy buena tu aportacion una cosa quiero saber, tambien se le puede aplicar a los avi, lo malo esque los subtitulos lo tienes incrustado en el .avi, no se si se pueda hacer de todas formas lo que me dices, por tu cooperacion muchas gracias, esperando respuesta positiva, muchas gracias.

As probado a reproducir el avi en el mpg y que se muestren los subtitulos? prueba y dime si tambien en la reproduccion se adelantan y si es asi el problema es que el fichero de subtitulos no esta sincronizado con el video. Pero eso tiene mas o menos facil arreglo.

Lo malo es si no es este el caso y los subtitulos se ven sincronizados al reproducir el video en el pc. En ese caso no hay forma de arreglar el asunto y mi consejo es que insertes los subtitulos en el avi antes de convertir este a mpg. Mas arriba tienes pegado el tutorial de como insertar subtitulos a un avi con el virtualdub.
Saludos...

Songoku

Pues mira cuanto tiempo dura la peli, osea cuando dicen la ultima frase subtitulada, despues usa el subtitle workshop, carga el fichero de subtitulos en el picando en "archivo" y en "cargar subtitulo", despues pica en "edicion" y selecciona "ajustar" y "ajustar subtitulos". En la ventanita que se te abre donde pone "ultima linea hablada" pon el tiempo en que dicen en la peli la ultima frase que deberia estar subtitulada y que la puedes leer en el mismo subtitle workshop si bajas la barra de scroll vertical de su ventana principal cuando tienes el archivo de subtitulos cargado. Una vez hayas puesto ese dato en la ventanita esa pues simplemente pica en el boton "ajustar!" y listo. Despues solo tienes que guardar los cambios picando en "archivo" y en "guardar" y ya esta.
Saludos...

Songoku