Lo siento, crei que esos codecs eran los que eran compatibles y el que se habia usado para comprimir el archivo. 
He hecho una captura con las dos cosas, la informacion del Avicodec y el error del virtualdub. En cuanto a la informacion que dices que sale a la derecha con la barra de desplazamiento en el avicodec, me salen columnas vacias, sin contenido.


Gracias Por tu paciencia

Txakra

Mola,
De momento ya he puesto a comprimir con subtitulos el primer archivo y por ahora funciona, ya es un paso, esperemos que el audio siga intacto.
Otra pregunta que te quería hacer es que hace un par de dias le metí subtitulos a una peli y  me pasó de 700Mb a 1,4Gb - ¿eso es el incremento normal por los subtitulos o se debe al tipo de compresion de video que le puse en el Virtualdub? creo que era un Divx 5.2. Es que me suenan muchos megas pa un adulto.

Muchas Gracias, un saludo.

Txakra

Hola songoku,
ya he probado un par de veces lo que me has comentado y tal y como te temias a los 30 segundos se pierde el audio.
Es curioso pero cuando le doy en Audio/Mpeg Layer 3-Todos la maxima calidad que me sale es 56 kbit, ¿puede venir el problema por ahí?

Un saludo.
Txakra