Problema con secuencia de escape Ctrl + z

import java.io.*;
public class CMediana {

public static void main(String[]args)
{

int temp = 0;
int i = 0;
int nElementos = 0;

final char eof = (char)-1;

do{
System.out.print("Cuántos elementos tendrá la serie? ");
nElementos = Leer.datoInt();
}while(nElementos < 1);

int []m = new int [nElementos];

System.out.println("Introduzca una serie de números");
System.out.println("Para salir pulse [Ctrl][z]");

do{
System.out.print("Número " + (i+1) + ": ");
m[i] = Leer.datoInt();
i++;
}while(i < m.length && m[i] != eof);
}
}

Citar

Número 4: Número 5: Número 6:

Por eso que te imprime, pienso que te hace falta "\n" (nueva línea) solo que no sé bien en donde.
Cómo has logrado que el programa termine?? (ctrl+z)?? como haces eso??
(Creo que eso requiere programacion orientada por eventos, en este caso seria al pulsar las teclas Control+z).

De todos modos hice esto espero que sirva de algo. Modifiqué un poco tu clase

Código:

import java.io.*;

public class CMediana {

	public static void main(String[]args)throws IOException
	{
		BufferedReader B = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
	    
		int temp = 0;
		int i = 0;
		int nElementos = 0;
		
		final char z = (char)122;
		
		do{
			System.out.print("Cuántos elementos tendrá la serie? ");
			String e = B.readLine();
			if(esEntero(e))
			nElementos = Integer.parseInt(e);
		}while(nElementos < 1);
		
		
		int []m = new int [nElementos];
		
		System.out.println("Introduzca una serie de números");
		System.out.println("Para salir pulse [Ctrl][z]");
		
		do{
			System.out.print("Número " + (i+1) + ": ");
			String c = B.readLine();
			if(esEntero(c))
			{
				m[i] = Integer.parseInt(c);
			}
			else if(c.charAt(0)==z || !esEntero(c) ){
				for(int j=i+1; j<m.length; j++)
					System.out.println("Número " + (j+1) + ": ");
					i = m.length;
			}
			i++;
		}while(i < m.length && m[i] != z);
	}
	
	public static boolean esEntero(String c)
	{
		try
		{
			Integer.parseInt(c);
			return true;
		}catch(Exception e)
		{
			return false;
		}
	}
}

Bueno en este caso reconoce la z o cualquier caracter(si asi lo deseas). Y al hacer esto te queda así.

Código:

Cuántos elementos tendrá la serie? 6
Introduzca una serie de números
Para salir pulse [Ctrl][z]
Número 1: 1
Número 2: 2
Número 3: z
Número 4: 
Número 5: 
Número 6: 

Process completed.

Saludos