Joder como se nota que no tienes idea de que es Orientacion a Objetos....
codigo asquerosamente programado y estructurado ... veo punteros y tambien veo printf dando
vueltas me parece mucho que te quedaste pegado con c++  ....

Saludos...

ya le hice las modificaciones a mi asqueroso codigo y me aparecen errores en donde tengo declaradas leeInt o leeDouble, me dice...leeInt cannot be resolved

public class Impuestos {
 
	public static void main(String[] args) {
		//constantes
		final double IVA=16.0;
		final double POR_RET_IVA=10.0;
		final double POR_RET_ISR=10.0;
		final double POR_ISR=11.0;
		final int MES_CAPTURA=1;
		final int CAPTURA_ING=2;
		final int CAPTURA_GAS=3;
		final int L_ING_ANUAL=4;
		final int L_GASTO_ANUAL=5;
		final int CALCULO_IMP=6;
		final int MESES=12;
		final int SALIR=7;
 
		//variables para entrada de datos
	    double gasto_iva,iva_pag,isr_pag,gan_bruta,
        gan_neta,isr,iva,subtotal,ret_isr,ret_iva,total,ingreso_tot=0,gasto_tot=0,ingreso,gasto;
 
        //variables de uso interno del programa
        int i,opcion,indice,mes_elegido=1;
        boolean ver_menu;
        String[] meses=new String[]{"Enero","Febrero","Marzo","Abril","Mayo","Junio",
                "Julio","Agosto","Septiembre","Octubre","Noviembre","Diciembre"};
       //Arreglo para ingresos y gastos//
       double gastos[];
       double ingresos[];
       for(i=0;i<MESES;i++)
       {
           gastos[i]=0;
           ingresos[i]=0;
       }
       ver_menu=true;
       do
       {
           System.out.println("CALCULO DE IMPUESTOS ANUAL");
 
           System.out.println("Menu principal:");
           System.out.println("1. Establecer mes para la captura (mes actual es %s)"+meses[mes_elegido-1]);
           System.out.println("2. Captura de ingresos");
           System.out.println("3. Captura de gastos");
           System.out.println("4. Mostrar lista de ingresos anual");
           System.out.println("5. Mostrar lista de gastos anual");
           System.out.println("6. Calculo de impuestos anual");
           System.out.println("7. Salir");
 
           System.out.println("Opcion: ");
           opcion=leeInt.ScanF();
           System.out.println(" "+opcion);
           switch(opcion)
           {
           case MES_CAPTURA:
              System.out.println("Establecer mes para captura");
              for(i=0,indice=0;i<MESES;i++,indice++)
              System.out.println(" "+(indice+1)+") "+meses[i]);
              System.out.println("Elige el mes (1 a 12):");
              mes_elegido=leeInt.ScanF();
              System.out.println(" "+mes_elegido);
              if(mes_elegido>MESES)
                 System.out.println("Mes no valido!");
              else
                 System.out.println("Se ha establecido el mes de captura en "+meses[mes_elegido-1]);
              break;
           case CAPTURA_ING:
              System.out.println("Captura de ingresos");
              System.out.println("Dame el ingreso del mes de "+meses[mes_elegido-1]+": ");
              ingreso=leeDouble.ScanF();
              System.out.println(" "+ingreso);
              ingresos[mes_elegido-1]=ingreso;
              break;
           case CAPTURA_GAS:
              System.out.println("Captura de gastos");
              System.out.println("Dame el gasto del mes de "+meses[mes_elegido-1]+": ");
              gasto=leeDouble.ScanF();
              System.out.println(" "+gasto);
              gastos[mes_elegido-1]=gasto;
              break;
           case L_ING_ANUAL:
              System.out.println("Mostrar lista de ingresos anual");
              for(i=0;i<MESES;i++)
                 System.out.println(" "+meses[i]+" = "+ingresos[i]);
              break;
           case L_GASTO_ANUAL:
              System.out.println("Mostrar lista de gastos anual");
              for(i=0;i<MESES;i++)
                 System.out.println(" "+meses[i]+" = "+gastos[i]);
              break;
           case CALCULO_IMP:
              for(i=0;i<MESES;i++)
              {
                  ingreso_tot+=ingresos[i];
                  gasto_tot+=gastos[i];
              }
              iva=(ingreso_tot*IVA)/100;
              subtotal=ingreso_tot+iva;
              ret_isr=(ingreso_tot*POR_RET_ISR)/100;
              ret_iva=(ingreso_tot*POR_RET_IVA)/100;
              total=subtotal-(ret_isr+ret_iva);
              gan_bruta=(ingreso_tot-gasto_tot);
              isr=(gan_bruta*POR_ISR)/100;
              gan_neta=(gan_bruta-isr);
              isr_pag=(isr-ret_isr);
              gasto_iva=(gasto_tot*IVA)/100;
              iva_pag=(iva-gasto_iva-ret_iva);
              System.out.println("CALCULO DE IMPUESTOS");
              System.out.println("***Tabla de Recibo de Honorarios***");
              System.out.println("Ingresos\t\t"+ingreso_tot);
              System.out.println("(+) IVA\t\t\t"+iva);
              System.out.println("(=) Subtotal\t\t"+subtotal);
              System.out.println("(-) Retención ISR\t"+ret_isr);
              System.out.println("(-) Retención IVA\t"+ret_iva);
              System.out.println("(=) Total\t\t"+total);
              System.out.println("***Tabla Ganancias***");
              System.out.println("Ingresos\t\t"+ingreso_tot);
              System.out.println("(-) Gastos\t\t"+gasto_tot);
              System.out.println("(=) Ganancia Bruta\t"+gan_bruta);
              System.out.println("(-) ISR\t\t\t"+isr);
              System.out.println("(=) Ganancia Neta\t"+gan_neta);
              System.out.println("***Tabla ISR***");
              System.out.println("ISR\t\t\t"+isr);
              System.out.println("(-) ISR Retenido\t"+ret_isr);
              System.out.println("(=) ISR a Pagar\t\t"+isr_pag);
              System.out.println("***Tabla IVA***");
              System.out.println("IVA\t\t\t"+iva);
              System.out.println("(-) Gastos IVA\t\t"+gasto_iva);
              System.out.println("(-) Retención IVA\t"+ret_iva);
              System.out.println("(=) IVA a Pagar\t\t"+iva_pag);
              break;
           case SALIR:
              ver_menu=false;
              break;
           default: System.out.println("Opcion no valida!");
          }
      }while(ver_menu);
	}
}

no se si se deba a que tengo adjuntada ScanF en el mismo package que Impuestos

Empieza con algo más sencillo. Buscate problemitas resueltos en java que te ayuden a entender mejor la metodologia de programacion orientada a objetos.

Lo digo como consejo. Ya tu elige lo que mejor veas oportuno.