Para poner un color permanente a una celda específica en una JList, puedes crear un modelo de lista personalizado que extienda DefaultListModel y anular el método getListCellRendererComponent para devolver un componente de celda personalizado que tenga un color de fondo diferente para la celda deseada. Aquí hay un ejemplo de cómo hacerlo:

import java.awt.Color;
import java.awt.Component;
 
import javax.swing.DefaultListModel;
import javax.swing.JFrame;
import javax.swing.JList;
import javax.swing.JScrollPane;
import javax.swing.ListCellRenderer;
 
public class ColoredJListDemo extends JFrame {
 
    private static final long serialVersionUID = 1L;
 
    public ColoredJListDemo() {
        setDefaultCloseOperation(JFrame.EXIT_ON_CLOSE);
        setTitle("Colored JList Demo");
 
        // Crea un modelo de lista personalizado con algunos datos de ejemplo
        DefaultListModel<String> model = new DefaultListModel<String>();
        model.addElement("Item 1");
        model.addElement("Item 2");
        model.addElement("Item 3");
 
        // Crea una lista personalizada que use el modelo personalizado y el renderizador personalizado
        JList<String> list = new JList<String>(model);
        list.setCellRenderer(new ColoredListCellRenderer(1, Color.YELLOW)); // La celda 1 se muestra con un color de fondo amarillo
 
        // Agrega la lista a un panel de desplazamiento y lo agrega al marco
        JScrollPane scrollPane = new JScrollPane(list);
        getContentPane().add(scrollPane);
 
        // Establece el tamaño y la posición del marco y lo muestra
        setSize(200, 200);
        setLocationRelativeTo(null);
        setVisible(true);
    }
 
    // Renderizador personalizado que establece el color de fondo de una celda específica
    private static class ColoredListCellRenderer implements ListCellRenderer<String> {
 
        private int targetIndex;
        private Color backgroundColor;
 
        public ColoredListCellRenderer(int targetIndex, Color backgroundColor) {
            this.targetIndex = targetIndex;
            this.backgroundColor = backgroundColor;
        }
 
        @Override
        public Component getListCellRendererComponent(JList<? extends String> list, String value, int index,
                boolean isSelected, boolean cellHasFocus) {
 
            Component component = list.getCellRenderer().getListCellRendererComponent(list, value, index, isSelected,
                    cellHasFocus);
 
            if (index == targetIndex) {
                component.setBackground(backgroundColor);
            }
 
            return component;
        }
 
    }
 
    public static void main(String[] args) {
        new ColoredJListDemo();
    }
 
}

En este ejemplo, el método getListCellRendererComponent devuelve el componente de celda predeterminado obtenido a través de list.getCellRenderer().getListCellRendererComponent y establece el color de fondo en backgroundColor si la celda actual es la celda objetivo (índice 1 en este caso). Luego, agrega el componente de celda modificado al modelo de lista personalizado para su uso en la lista.