Cada uno tiene sus pros y contras, yo suelo usar la clase por si lo necesito pasar en algun momento en algun metodo que esto se haga siempre por referencia, y claro esta, que dicha clase Boolean contenga sus metodos respectivos que aunque no resultaria dificil pasar sin ello en el tipo primitivo ya que estan hechos pues....

La uncia contraprtida que creo que podemos tener en cuanto a crear un objeto y no usar el tipo definido es el espacio de memoria reservado que es mayor en el caso de la clase,¿pero acaso con los dispositivos con los que nos movemos estos dias es este un factor tan relevante, ya que esta diferencia es despreciable...?